O Centro Internacional do Hongwanji, anteriormente conhecido como Shishinji (Templo Shishin), foi construído em sua localização atual em 1973, graças à generosa doação do Sr. Seiichi Hirose. Na ocasião se comemorava os 800 anos do nascimento de Shinran Shonin e os 750 anos da fundação do Jodo Shinshu. Desde o seu estabelecimento, o Centro tornou-se o abrigo do Shishin Kyodo, um templo que está diretamente associado ao Honzan (templo matriz).

Em 1942, o Shishinji, que foi originalmente construído no Kamigyo-ku (bairro norte de Quioto), servia como dormitório para um grupo de estudo conhecido como o Shishinkai. Mais tarde, em 1953, foi reconhecido pelo Hongwanji como um templo subsidiário da Matriz.

Em 1957, quando o BCA (Igrejas Budistas da América) procurava estabelecer um centro de estudo e pesquisa para os aspirantes estudantes missionários do exterior em Quioto, as instalações do Shishinji foram cedidas gratuitamente. Três anos mais tarde, o prédio e o terreno foram doados para o Hongwanji, com a intenção de ser utilizado para atividades de propagação no exterior. Logo em seguida o nome foi alterado para Hongwanji Shishin Kyodo. As ações foram vendidas em 1971, e o lucro ficou como o alicerce do financiamento, o qual se somou às contribuições feitas a partir dos distritos exteriores e do Hongwanji para a construção do Centro. Quando a construção foi concluída em novembro de 1973, os ornamentos do altar do Shishin-Kyodo foram adicionados e o Departamento Internacional iniciou suas atividades no primeiro andar do prédio. A sala em que o altar fica desde então tem sido chamado de Shinshindo.